На первом уровне управления находится заведующий детским садом, который осуществляет руководство и контроль за деятельностью всех структур. А также органы самоуправления ДОУ: Педагогический совет и Совет Образовательного учреждения.

Заведующий выполняет свои функции в соответствии с должностной инструкцией. Указания и распоряжения заведующего обязательны для всех участников воспитательно-образовательного процесса.
Непосредственно управление МКДОУ №3 осуществляет заведующий Ильясова Лимуният Ибнуяминовна, которая действует от имени учреждения в соответствии с Уставом.

Третий уровень управления осуществляют воспитатели, учителя-логопеды, педагог-психолог, музыкальные руководители, медицинские сестры,  младший обслуживающий персонал. На этом уровне объектами управления являются дети и их родители.